進水水溫低于 8℃時，活性污泥的活性受到一定的影響，此時要適當降低出水量，保證污水中有機物在反應池內得到充分的降解，從而確保出水水質。減緩膜堵塞。

     在氣溫發生突變的季節中尤其要注意觀察出水水質，如出水水質有突變時，要減少適當出水量、增加曝氣時間。

     正常運行時，應極力避免對微生物新陳代謝有抑制作用的消毒液、消毒劑混入生物反應池中。防止設備中微生物的正常生物機理受到破壞，導致出水惡化。

      當污水中含有大量的合成洗滌劑或其他起泡物質時，膜生物反應池會出現大量泡沫，此時可采取噴水的方法解決，但不要向反應池內加入含有油性物質的消泡劑來去除泡沫。也不可使用硅膠系列消泡劑。硅膠系列消泡劑被吸附到膜表面，會加快膜間差壓的上升，使膜堵塞。此時，即使用藥液清洗也很難恢復壓差，需要更換膜。
      MBR工藝系統應定期排放一定量的剩余污泥。排泥量可根據污泥沉降比、混合液污泥濃度、活性污泥的有機負荷或污泥齡來確定。

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